Le service de santé a pour mission :
- exécuter les orientations du C/FDNB en matière sanitaire ;
 - élaborer les directives de l’EMG en matière sanitaire ;
 - assurer le soutien médical a la FDNB ;
 - coordonner les formations sanitaires militaires;
 - participer au maintien de la sante publique ;
 - fournir l’expertise médicale du personnel de la FDNB ;
 - collaborer avec les autres partenaires de la sante tant nationaux qu’internationaux ;
 - participer à la formation du personnel médical ;
 - prévenir les maladies mentales et la transmission du VIH/SIDA au sein de la FDNB ;
 - assurer la prise en charge psychosociale des militaires et leurs familles ;
 - établir les besoins en médicaments et en matériels médico-chirurgicaux ;
 - assurer la valorisation des soins médicaux, des produits pharmaceutiques et des matériels médico-chirurgicaux ;
 - assurer la valorisation des soins médicaux, des produits pharmaceutiques et des matériels médico-chirurgicaux.